별첨 : 생물정보분석팀 분석 실기시험 자료

생물정보분석 평가

1. 평가장소:

1) 생물정보 분석, 국립암센터 내 생물정보분석 서버실

2) 생물정보 분석 내용 발표평가, 국립암센터 연구동

2. 국립암센터 서버실 이용 기간 : 총 1일

1) 서버실 ID PW 지급 및 필요한 software 설치

2) Whole genome sequencing 분석용 bam 파일 제공 (22번 염색체 point mutation은 필수, Translocation은 선택, In/del 분석 제외)

Whole exome-seq 분석용 fastq 파일 제공 (point mutation과 In/del분석)

3. 국립암센터 내 서버 이용시 유의사항:

1) 상이한 시스템에 따른 간단한 서버 컴퓨터 사용에 대해 문의 가능.

2) 제시된 시험용 raw data를 대상으로 국립암센터 내 서버컴퓨터를 이용하여 지원자들이 직접 생물정보학 정보분석.

3) 분석에 필요한 프로그램은 모두 국립암센터 서버컴퓨터에 각자 설치하여야 하며, 설치하는데 문제가 있는 경우 문의 가능.

4) 공용으로 download받을 수 있는 프로그램 이외에 개인적으로 사용하는 프로그램은 사용할 수 없음. download 받을 프로그램에 대해 서버관리자 승인필요. 승인 받지 않은 프로그램 사용으로 문제가 발생하면 책임을 물을 수 있음.

5) 외부로 시험용 시료 data는 반출할 수 없음. Presentation을 위한 raw data processing 결과는 반출 가능.

6) 서버실은 1일간 오전 9시 ~오후 5시까지 이용가능

7) 분석 이외 비정상적인 사용으로 인한 서버컴퓨터 장애에 대해서는 책임을 물을 수 있음.

4. 발표평가(실무 면접심사위원회) : raw data processing이 끝나고 1주일 이내 진행되며, 30분 발표 20분 질의 응답

1) 분석결과를 기반으로 지원자가 도표와 도식 작성.

2) 발표 시 설치 프로그램, 유전체 분석 전체 과정 및 결과를 presentation. 분석 결과 중 비특이적인 돌연변이를 제거하는 과정도 설명. 채용 후 사용할 수 없는 tool의 사용은 발표에서 제외하여야 하며, 서버컴퓨터를 이용한 분석 결과와 다른 발표내용이 있는 경우 반드시 이유를 발표자료에 기술하여야 함.

3) 발표자료는 1일 전 미리 제출하여야 함.

4) 외부의 도움 없이 전 과정을 준비하여야 하며, 선발 이후에라도 도움을 받았다는 사실을 알게 되면 채용이 취소될 수 있음.